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役員
平成21年5月21日総会終了時点、役職中順不同
| 役職 | 氏名 | 所属・役職 |
| 理事長 | 三上 貞芳 | 公立はこだて未来大学 教授 |
| 副理事長 | 工藤 伍郎 | JF十三漁業協同組合 代表理事組合長 |
| 副理事長 | 長野 章 | 公立はこだて未来大学 教授 |
| 専務理事 | 大塚 夏彦 | 北日本港湾コンサルタント(株) 技術部 部長 |
| 常務理事 | 古屋 温美 | 北海道大学大学院水産科学研究院 特任准教授 |
| 理事 | 若林 隆司 | (株)アルファ水工コンサルタンツ 特任執行役員(取締役) |
| 理事 | 桑原 伸司 | 北日本港湾コンサルタント(株) 技術部 次長 |
| 理事 | 鳴海 日出人 | 海洋環境デザイン(株) 代表 |
| 理事 | 岡本 純一郎 | 北海道大学大学院水産科学研究院 教授 |
| 理事 | 松石 隆 | 北海道大学大学院水産科学研究院 教授 |
| 理事 | 本間 正彦 | 函館市水産市場仲卸協同組合 理事長 |
| 理事 | 川崎 一好 | 厚岸漁業協同組合 代表理事組合長 |
| 理事 | 浅川 典敬 | (財)漁港漁場漁村技術研究所 第一調査研究部 部長 |
| 理事 | 久保田 弘道 | (株)エステム 東京支店 |
| 監事 | 金子 友美 | (株)日本海洋生物研究所 取締役支店長 |
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